始めるにあたって
１−プロローグ
２２世紀、太陽を中心とした地球の対称点に一大スペースコロニー団「イシス」が建造された。コロニーは、移住用の「ランド１」「ランド２」工業用の「サテライトベース」それらの周辺にある資材用小惑星「ヴェスタ」の破片で構成されており、移民した人々は新たな社会を、この｢第二の地球」である「イシス」に築いていった。
だが、イシス暦００２４年、ランド２のバイオ研究所でバイオハザードが起こり、研究所から謎の変異生命体が流出したのである。変異体は瞬く間にランド２全域に広がり，多くの市民の命を奪うと同時に動植物達を突然変異させた。当初の事件は偶発的な事故と見なされていたが、実際はそうではなかった。
「イシス」の行政をつかさどっていたタニア、トーゴ、オレギ、レデスマ、ウエーバーの五人の大統領「プレジデンフトファイブ」。その内のオレギ、レデスマ、ウエーバーの３人はクーデターを起こしたのである。バイオハザードはその序曲に過ぎなかったのである。
クーデターを起こした３人はバイオの力を手に入れ「バイオノイド３将軍」を自称。ミュータント部隊を組織して、機械兵団クリーチャー部隊を創設。バイオ軍を結成してタニアを幽閉した。
クーデターを成功させたバイオ軍はついにランド２を制圧し，更にランド１へと侵攻を開始した。
一方、プレジデントファイブ最後の一人トーゴはレジスタンス部隊を組織しバイオ軍への徹底抗戦を呼びかけた。しかし、バイオ軍の背後には、バイオカイザーと呼ばれる謎の存在が、、、
事態を重く見た地球連邦政府は、コロニー団への調査隊を次々と派遣したが派遣された宇宙艇も次々と消息を立つ。そして今、ジンの乗る最後の調査隊のランド１のポートに入ろうとしていた。
パイロットのジンは自らを待つ運命をこの時まだ知らない。
イシス戦争系譜 （説明書より抜粋）
| イシス暦００２４年 | ランド２のバイオ研究所で事故発生。原因は不明。 |
| イシス暦００２５年 | バイオ研究所から流出した微生物でランド２汚染。
ミュータント誕生。 |
| イシス暦００２６年 | バイオノイド３将軍、バイオ軍を結成。
バイオ軍、機械兵クリーチャー部隊を組織。 |
| イシス暦００２７年 | バイオ軍、ランド１に侵攻。 |
| イシス暦００２８年 | バイオ軍、ランド１をほぼ制圧。
イシス星団、地球との交信を完全に断つ。 |
| イシス暦００２９年 | ウルフ隊長率いるサイボーグ部隊、ランド２到着。
第３時調査隊、ランド１到着。消息不明。 |
２−操作方法
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メニューを呼び出すと，メニュー画面上部には行動中のメンバー（最大４人）のステータスが表示されます。Ｒ・ＨＰ・ＢＰはそれぞれランク（レベル）・ヒットポイント・バトルポイントを示しており、ステータスの部分には状態異常、又は感情変化があらわされています。
メニュー画面下部にはメニューコマンドが並びます。詳細は以下のとおり。
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３−ジンとその仲間たち−能力値と装備は仲間になった時の物
| キャラ名 | |||||||||
| タイプ | ＨＰ | ＢＰ | レベル | パワー | ブレイン | アタック | ガード | スピード | 経験値 |
| 初期装備 | |||||||||
| 決め技 | |||||||||
| 戦闘指令 | |||||||||
| 一言 | |||||||||
| ジン ○○○○（オースチン） | |||||||||
| パワー型 | ７５ | ５００ | １ | ５ | ７ | ２ | ０ | ５ | ０ |
| なし | |||||||||
| アタック/敵一体に５０ダメージ。−ＭＡＸＨＰの４分の１を消費
ラリアート/敵一体に１００ダメージ。−ＭＡＸＨＰの４分の１を消費 |
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| −よく見て戦え！−レベルの高い敵から攻撃する | |||||||||
| ・名前の○○○○の部分には最初に入力した名前が入ります−入力しなければ無表示。
・ジンは敵を２００回倒す毎に決め技を覚えて（パワーアップさせて）いきます。 |
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| デニム ロシモフ | |||||||||
| パワー型 | ４９４ | １０００ | ３ | １９ | ８ | ９ | ０ | ８ | ３６ |
| コロナ銃・シリコンメット | |||||||||
| クラッシャー/クリーチャーにはＭＨＰの８割、ミュータントにはＭＨＰの３割のダメージ。全対象−ＭＡＸＨＰの８分の１を消費 | |||||||||
| −決め技勝負！−決め技を中心にして攻撃 | |||||||||
| 最初に仲間に出来るメンバーです。ＨＰは高め。決め技のクラッシャーはクリーチャー相手に絶大な威力を発揮するので、序盤の低戦力時にはとても助かる能力です。能力が乏しいので後半には他のキャラに席を譲る事になるでしょう。 | |||||||||
| クリス ソマーズ | |||||||||
| バランス型 | ９６４ | １０００ | １０ | ２２ | １４ | １１ | ０ | ５５ | １８７０ |
| オキシドガン・シリコンメット・シリコンアーム | |||||||||
| フラッシュ/敵の攻撃を１ターン回避−ＭＡＸＨＰの半分を消費 | |||||||||
| −ＨＰ気をつけて！−ＨＰ回復を最優先する | |||||||||
| ランド１で出会う戦士で、タムの姉代わりでもあります。ややパワー傾向のバランス型でＨＰはかなり低くなっています。非常にパニックになりやすいので常に感情パラメータに気を配りましょう。決め技のフラッシュは強力ですが消費が激しい所がネックになっています。 | |||||||||
| アストロ ラング | |||||||||
| ブレイン型 | １２３５ | ２０００ | １３ | ３２ | ４７ | １６ | ０ | ３４ | ５０４８ |
| なし | |||||||||
| ボンバー/味方の攻撃力を２倍、命中率を１００％にする−ＭＡＸＨＰの４分の１を消費 | |||||||||
| −敵をぶっ飛ばせ！−決め技・武器を使って攻撃する | |||||||||
| アイアン部隊の熱血漢。ブレインの方が高いので銃を装備させると効果的です。決め技のボンバーは一定時間で効果が切れるものの、長期戦闘には非常に有用です。ボス戦には是非とも連れて行きたいメンバー。 | |||||||||
| チック | |||||||||
| バランス型 | １５６２ | ２０００ | １３ | ３２ | ３４ | １６ | ０ | ６３ | ６２２３ |
| ロボテクト１ | |||||||||
| なし | |||||||||
| −ヒットエンドラン！−普通に攻撃する | |||||||||
| トムトム博士に作られたロボット。ＢＰ転送能力がある為、長旅には必要不可欠な存在です。 | |||||||||
| キエサ フランク | |||||||||
| パワー型 | ２７４９ | ３０００ | １８ | ７０ | ４１ | ３５ | ０ | ４７ | ２８７６０ |
| 石化銃・チタンメット・アルミナアーム | |||||||||
| なし | |||||||||
| −守りを固めろ！−回復・治療を優先して戦う | |||||||||
| 物資輸送部隊のサイボーグ戦士。 ロボ回復の使えるキャラなのでロボットをパーティに加える時は一緒に連れて歩きたい仲間。 ＨＰが低めなのが注意。 | |||||||||
| パミル ファルダ | |||||||||
| パワー型 | ３４８８ | ４０００ | ２２ | ６１ | ４０ | ３０ | ０ | １０６ | ５４８１２ |
| ソリッドガン・チタンアーム・アルミナレッグ | |||||||||
| なし | |||||||||
| −能力を有効に！−間接・特殊能力を多様 | |||||||||
| サイボーグ部隊の戦士。能力のロボ修理はロボットが錆びた場合に非常に助かる能力ですが、残念ながらロボットが錆びる状態にはあまり遭遇しません。スピードがあるので速攻戦闘を展開させましょう。 | |||||||||
| タック | |||||||||
| バランス型 | ３９３７ | ４０００ | ２３ | ６２ | ６４ | ３１ | ０ | ５６ | ６４１２５ |
| メカスパーク・ロボテクト４ | |||||||||
| なし | |||||||||
| −ヒットエンドラン！−普通に攻撃 | |||||||||
| メカショップセンターにいるロボット。どうしてもチックと比較してしまう為、影の薄い存在になってしまいます。しかし、タックの凄い所は、成長率が他キャラの１,５倍のスピードである事。あっという間に成長してしまいます。 | |||||||||
| リタ | |||||||||
| バランス型 | ４１６２ | ５０００ | ２６ | ６１ | ５４ | ３０ | ０ | １１０ | １０９４２７ |
| スパークサーベル・セラミメット・セラミアーム・チタンボディ | |||||||||
| クールビート/全ての敵のＨＰを吸い取る−ＭＡＸＨＰの４分の１を消費 | |||||||||
| −無理せず戦いましょう！−味方のＨＰと状態の回復を優先して戦う | |||||||||
| ミューと心を通わせる事の出来るバイオ感応者。パワーやガードは他キャラより低いものの、ＨＰに関しては他キャラの追随を許しません。回復能力が完璧なので戦闘補佐として活躍してくれます。決め技のクールビートは敵のＨＰを吸い取るものの、結局消費ダメージの方が上回ってしまいます。使うなら他よりややＨＰ消費の少ない全体攻撃と割り切りましょう。 | |||||||||
| リュウ ライチン | |||||||||
| バランス型 | ３５６９ | ７０００ | ３０ | ９８ | １０４ | ４９ | ０ | １２０ | １８３４２３ |
| ウイルスバズーカ・セラミメット・チタンアーム・チナンレッグ | |||||||||
| なし | |||||||||
| −イシスのゴミとなりやがれ！−武器のみでの攻撃 | |||||||||
| 感情の起伏が激しいサイボーグ戦士。決め技もキット能力も所有していない為通常攻撃しか出来ませんが、基礎能力値が他キャラの１,５倍〜２倍と尋常でない高さを誇ります。きっちり育てていけば最初にランク６の武器を装備するメンバーになるでしょう。恐らく最後に仲間にする事になると思いますが、シナリオの通り道には存在しないのでうっかり忘れて仲間にしないままクリアしてしまう事もあると思います。 | |||||||||
４−状態異常一覧
４，１−ステータス異常−全て「ターミナル」で回復ができます。
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４，２−感情パラメータ−戦闘中、特に何の攻撃を受ける訳でもなく突然（ランダム？）感情が変化し、戦闘後も持続します。当然の如く、ロボットであるチックとタックにはありません。
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５−マップ
マップはマクロフィールドとミクロフィールドに分かれています。マクロフィールドはランド１とランド２の地上部分の事、ミクロフィールドは建物内や通路、ヴェスタ等の事です。マップ画像はこちら
ミクロフィールド内では移動方法は徒歩のみですが、マクロフィールドでは基本的に何かしらの乗り物を使って移動する事になります。乗り物は以下の４種類。
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６−戦闘画面
画面上部にあるメーターはそれぞれの敵のＨＰを比率で表したもので、メーターが満タン（６メモリ）の時はダメージを受けていない事を示しています。６個しか無い事から敵は同時に７体以上では出現しません。
画面下部にはメンバーのＨＰ・ＢＰ・ステータスが表示され、その左側に戦闘メニューが示される。メニューは以下のとおり。
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敵かこちらが全滅すると戦闘は終了します。
戦闘に勝利した時は、各メンバーに経験値が入りますがお金は手に入りません。戦闘終了時に各敵に設定された賞金ポイントが記録され、ターミナルに戻った時にそれまで倒した敵の賞金ポイントをお金に換金するシステムになっています。
戦闘に負けた時は最後に立ち寄ったターミナルに戻されます。ジンのＨＰは１、その他のメンバーは瀕死の状態となっており、又換金していない賞金ポイントは無くなってしまいます。
７−キット能力
能力とはファンタジーＲＰＧでいう所の魔法にあたる物で、リュウを除く各キャラがＢＰを消費して使用する事ができます。ただし、使う為には元となるキットを所有していなければなりません。
キットは人から貰ったり、コンテナ内にあるので頑張って全てを集めましょう。
| 説明 | |||||
| 名称 | 使用者 | 消費量 | 必要キット | 入手経路・場所 | 効果 |
| 回復−人間・サイボーグ一人のＨＰを回復する | |||||
| ＨＰ回復１ | デニム･ジン
パミル･リタ |
１００ | ＨＰキット１ | デニムから | ＨＰを５００回復 |
| ＨＰ回復２ | ジン･パミル･リタ | ３００ | ＨＰキット２ | ロボット工場 | ＨＰを１０００回復 |
| ＨＰ回復３ | パミル･リタ | ６００ | ＨＰキット３ | パミルから | ＨＰを２０００回復 |
| ＨＰ回復４ | リタ | ９００ | ＨＰキット４ | オレンジキャンプ | ＨＰを３０００回復 |
| ＨＰ回復５ | チック・タック | ６６２
２５０ |
医療キット | コーンエリア河川内の建物 | ＨＰを５０００回復 |
| ロボ回復−ロボット一体のＨＰを回復する | |||||
| ロボ回復１ | キエサ | ２５０ | ロボＨＰキット１ | キエサから | ＨＰを１０００回復 |
| ロボ回復２ | キエサ | ５００ | ロボＨＰキット２ | バイオの砦 | ＨＰを２０００回復 |
| ロボ回復３ | キエサ | １３００ | ロボＨＰキット３ | コーンエリア河川内の建物 | ＨＰを５０００回復 |
| ＢＰ転送−本人以外の一人のＢＰを回復する | |||||
| ＢＰ転送１ | チック | ５０ | ＢＰキット１ | チックから | ＢＰを５００回復 |
| ＢＰ転送２ | チック | １００ | ＢＰキット２ | メカショップセンター | ＢＰを１０００回復 |
| ＢＰ転送３ | チック | ３００ | ＢＰキット３ | オレンジキャンプ壁空間 | ＢＰを２０００回復 |
| 状態回復−人間・サイボーグ一人の状態を回復する | |||||
| 励まし | ジン･キエサ | ２５０ | 励ましキット | エレキシティ | パニックを治し、精神を高揚させる |
| しっかり１ | クリス･アストロ･リタ | １５０ | しっかりキット１ | クリスから | 麻痺･貧血を治す |
| しっかり２ | アストロ･リタ | ２００ | しっかりキット２ | アストロから | 麻痺･貧血･混乱を治す |
| しっかり３ | リタ | ３００ | しっかりキット３ | オレンジキャンプ | 麻痺･貧血･混乱･骨抜きを治す |
| ロボ状態回復−ロボット一体の状態を回復する | |||||
| ロボ修理 | パミル | １００ | 修理キット | パミルから | 錆びるを治す |
| 戦闘補助１−敵の基本能力を下げたり状態異常にさせる（全体） | |||||
| 幻惑 | ジン･パミル | ４００ | 幻惑キット | メカショップセンター | 混乱させる |
| 金縛り | ジン･キエサ | ３００ | 金縛キット | キエサから | 動きを止める |
| もたつき | デニム | ３００ | もたつキット | ファイバーシティ壁空間 | スピードダウン |
| 萎えるん | パミル | − | 萎えるんキット | ミュー研究所 | パワーダウン |
| 守れな | タック | ４００ | 守れなキット | タックから | ディフェンスダウン |
| 戦闘補助２−味方一人の基本能力を上げる | |||||
| 加速 | クリス | ３００ | 加速キット | アイアンシティ壁空間 | スピードＵＰ |
| きめまさ | アストロ | ３００ | きめまさキット | セラミシティ壁空間 | パワーＵＰ |
| やられな | キエサ | ３００ | やられなキット | コーンエリアクルーザーポート | ディフェンスＵＰ |